Литература

1. Голян, С. Н. Труд и здоровье женщин / С. Н. Голян // Охрана труда. — 2000. — № 7. — С. 6–8.

2. Лопатина, Н. В. Они — женщины! / Н. В. Лопатина // Охрана труда и социальная защита. — 2003. — № 5. — С. 24–26.

3. Сиденко, А. Т. Нужна система мер по охране труда и здоровья работающих женщин / А. Т. Сиденко // Охрана труда и социальная защита. — 2004. — № 9. — С. 60–63.

УДК 616-036.22

АНАЛИЗ ПРОСТРАНСТВЕННЫХ СВЯЗЕЙ ПОПУЛЯЦИИ N. MENINGITIDIS

В БЕЛАРУСИ С ПОПУЛЯЦИЯМИ ДРУГИХ СТРАН

Синюк К. В.

Научные руководители: д.м.н., профессор Л. П. Титов, к.м.н., доцент А. М. Дронина

Учреждение образования

«Белорусский государственный медицинский университет»

г. Минск, Республика Беларусь

Введение

Расшифровка нуклеотидных последовательностей N. meningitidisявляется одним из основных методов эпидемиологического мониторинга за возбудителем менингококковой инфекции благодаря возможности тонкой дифференциации штаммов, определения механизмов популяционной динамики, эволюции патогена и их влияния на эпидемический процесс. Мультилокусное сиквенс-типирование (МЛСТ) изолятов возбудителя основывается на cеквенировании фрагментов 7 генов домашнего хозяйства. Каждый фрагмент гена, отличающийся на один нуклеотид, рассматривается как уникальный аллельный вариант с присвоением соответствующего номера. Совокупность аллельных вариантов конкретного изолята определяет его сиквенс-тип. Близкородственные штаммы с несколькими совпадающими аллельными вариантами и произошедшие от одного предшественника объединяются в клональные комплексы.

Цель

Определить географические взаимосвязи популяции N. meningitidis, циркулирующей на территории Республики Беларусь, с популяциями менингококка других стран.

Материалы и методы

В качестве объектов исследования были использованы 26 изолятов N. meningitidisиз разных областей Беларуси, выделенных на протяжении 2006–2010 гг. [1]. Условия реакции амплификации и секвенирования, а также последовательности праймеров соответствовали стандартным [2]. Поиск филогенетически сходных с белорусскими сиквенс-типов и изолятов проведен с помощью BIGSdb [3] в международной базе данных изолятовN. meningitidis, типированных по МЛСТ схеме (pubmlst.org/neisseria).

Результаты и обсуждение

При сиквенс-типировании 20 изучаемых изолятов были определены ранее не встречавшиеся в базе данных сочетания аллельных вариантов, которые явились основой для создания новых сиквенс-типов. Для более половины (61,5 %) всех изолятов была определена принадлежность к клональным комплексам. Наиболее часто среди данных изолятов встречаются сиквенс-типы, относящиеся к клональным комплексам ST-41/44 (46,7 %) и ST-103 (30 %). Одним изолятом представлен каждый из клональных комплексов ST-53, ST-18, ST-11. Следует отметить, что из 51 существующих комплексов ST-41/44 является наиболее крупным по числу относящихся к нему изолятов в базе данных, а ST-11 и ST-18 комплексы также относятся к первым десяти наиболее крупным клональным комплексам. Поэтому можно заключить, что ряд сиквенс-типов, циркулирующих на территории Республики Беларусь, относится к широко распространенным клональным комплексам, встречающимся в различных странах.

Для определения степени уникальности изучаемых сиквенс-типов был проведен поиск сиквенс-типов, совпадающих с изучаемыми аллельными вариантами 4 и 5 фрагментов генов из МЛСТ схемы. Для сиквенс-типов с клональной принадлежностью число найденных по совпадению 4 фрагментов генов изолятов составляло от 37 для сиквенс-типа ST-8577 (ST-174 комплекс) до 811 изолятов для ST-3346 (ST-41/44 комплекс). Среднее число найденных изолятов, приходящихся на один клональный сиквенс-тип равно 284,1, на один сиквенс-тип, относящийся к ST-41/44 комплексу, — 533,8, что указывает на прямую связь между распространенностью клонального комплекса и количеством изолятов. Соотношение изолятов с сиквенс-типами, совпадающими с изучаемыми по 5 и по 4 фрагментам генов, составляет соответственно 1:3,7. Для изучаемых сиквенс-типов, не относящихся к клональным комплексам, число изолятов с совпадающими по 4 локусам сиквенс-типами составило от 0 для ST-8851 до 37 для ST-8546, среднее число изолятов, приходящихся на одни сиквенс-тип равно 17,4, что достоверно (p < 0,01) меньше аналогичного показателя для клональных сиквенс-типов. Такое малое число изолятов с родственными сиквенс-типами свидетельствует об уникальности выделенных на территории Беларуси неклональных сиквенс-типов. Соотношение изолятов с сиквенс-типами, совпадающими с изучаемыми по 5 и по 4 фрагментам генов, составило 1:6,2, что также подтверждает уникальность сочетания аллельных вариантов данных сиквенс-типов.

Для определения взаимосвязей выделенных в Беларуси сиквенс-типов с сиквенс-типами других стран был проведен анализ распределения по странам изолятов, которые имели 4 локуса, совпадающие с изучаемыми. Значительная часть (70,8 %) изолятов со сходными с белорусскими клональными сиквенс-типами была выделена в европейских странах, 11,4 % изолятов были типированы в Северной Америке, остальная часть распределилась между странами Африки, Азии и Южной Америки. На данное распределение изолятов значительно влияет неравномерность их типирования — 71,6 % изолятов в базе данных были выделены в Европе. Изоляты, родственные неклональным изучаемым сиквенс-типам, чаще встречались в европейских странах (87 %), 9,5 % — в странах Азии, остальная часть изолятов равномерно распределилась по странам других частей света. Для анализа распределения изолятов по европейским странам с целью снижения влияния различия в размерах выборок изолятов между странами на структуру распределения изолятов были использованы относительные значения, равные соотношению изолятов, найденных в данной стране к числу всех изолятов, выделенных и типированных по МЛСТ схеме в данной стране. Изоляты, сходные с клональными изучаемыми нами сиквенс-типами, распределились равномерно между европейскими странами без выраженного преобладания в какой-либо стране. Распределение сходных с неклональными сиквенс-типами изолятов свидетельствует о явной филогенетической связи с изолятами, выделенными в странах Восточной Европы: 30 % в структуре родственных изолятов относится к Польше, 24 % — к России, 13 % — к Словении и 11 % — к Чехии.

Выводы

Изоляты N. meningitidis, выделенные на территории Республики Беларусь, можно разделить на группу сиквенс-типов, принадлежащих клональным комплексам, и группу сиквенс-типов без установленной клональной принадлежности. Группа клональных сиквенс-типов является производным широко распространенных в Европе клональных комплексов. Группа неклональных сиквенс-типов является эндемичной для Беларуси и филогенетически связана с популяциямиN. meningitidisв странах-соседях Беларуси и некоторых странах Восточной Европы. Таким образом, заболеваемость менингококковой инфекцией на территории РБ обуславливается как панъевропейскими, так и эндемичными сиквенс-типамиN. meningitidis.