1036, 1099,1132, 2870, 27010, 1046, 387 (Днк-лестница 50 bp)

Изучены гены qacA/B и smr различных видов стафилококков (включая различные серовары MRSA), сиквенсы которых были получены из международного банка геномов NCBI GeneBank [4].

Построены дендрограммы хода молекулярной эволюции генов qacA/B и smr с использованием программы MEGA5.03 в масштабе с длинами делений, аналогичными эволюционным расстояниям, используемым для построения филогенетического дерева. Эволюционные расстояния были рассчитаны с использованием Maximum Composite Likelihood method. Эволюционный анализ был проведен с использованием метода UPGMA.

Результаты исследования и их обсуждение

Использованный метод экстракции плазмид позволяет выявлять плазмиды грамположительных и грамотрицательных микроорганизмов. В процессе амплификации qac A/B и smr генов образуются ампликоны размером по 350 п.о. Было установлено, что среди исследованных культур грамположительных (n = 32) микроорганизмов вида S. aureus ген smr выявлен у 94 % штаммов (n = 30), ген qacA/B выявлен у 75 % штаммов (n = 24).

Наблюдается более высокая частота встречаемости генов qacA/B и smr у резистентных к метициллину стафилококков (по сравнению с неустойчивыми по отношению к метициллину штаммами), обуславливающая высокие адаптационные возможности этих биовариантов к внутрибольничным условиям и проводимым в них противомикробным мероприятиям.

Проведенный биоанализ сиквенсов плазмидных qacA/B, smr генов подтверждает существование четких генетических групп, что свидетельствует о независимом приобретении этого гена несколькими изолированными штаммами-предшественниками.

Выводы

В рамках проведенной работы:

1) разработан метод экстракции плазмид у стафилококков и других микроорганизмов;

2) разработан метод ПЦР детекции плазмидных генов qacA/B и smr, ассоциированных с устойчивостью к дезинфектантам, который позволяет по присутствию ампликонов размером 350 п.о. проводить детекцию qacA/B и smr генетической детерминанты;

3) установлена частота встречаемости генов qacA/B и smr среди резистентных к метициллину стафилококков, показатели которой являются более высокими в сравнении с частотой встречаемости этих генов у нерезистентных к метициллину стафилококков;

4) изучен ход эволюции генов qacA/B и smr.