Согласно административной реформе структура Федеральной службы в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека образована следующими учреждениями:

- Управления Роспотребнадзора по субъектам Российской Федерации (в Российской Федерации организовано 84 Управления Роспотребнадзора).

- Федеральные государственные учреждения здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии» (в Российской Федерации организовано 85 ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии»).

- Учреждения дезинфекционного профиля (в Российской Федерации организовано 35 учреждений дезинфекционного профиля).

- Противочумные станции и центры (в Российской Федерации организовано 13 противочумных станций и центров).

- Федеральные учреждения науки (в Российской Федерации организовано 29 Федеральные учреждения науки).

- Учреждения иного профиля.