Таксоны, применяемые в бактериологии:

Домен (Domain) — группа рангом выше царства, объединяющая разные организмы, обладающие определенным набором общих черт.

Царство (Kindom) — совокупность типов бактерий.

Тип (Phylum) — совокупность классов бактерий.

Класс (Class) — совокупность порядков бактерий.

Порядок (Order) — совокупность семейств бактерий.

Семейство (Family) — совокупность взаимосвязанных родов бактерий, базируется на основе типового рода.

Род (genus) — совокупность близкородственных видов, базируется на основе типового вида.

Вид (species) — основной таксон в классификации бактерий — эволюционно сложившаяся совокупность особей, имеющих экологическое единство и близкий генотип, который в стандартных условиях проявляется сходными морфологическими, физиологическими, биохимическими признаками и антигенной структурой. Критерий репродуктивной изоляции у некоторых бактерий не является строгим, всегда выражен лишь до уровня семейств, возможен обмен генетическим материалом между близкородственными родами (например, Salmonella, Shigella, Escherichia) и приобретение бактериями новых свойств (например, изменение спектра чувствительности к антибиотикам).

Подвиды (внутривидовые категории) — совокупность популяций определенного вида, отличающихся рядом признаков, не препятствующих объединению в вид.