Фиксированные препараты окрашивают по Романовскому-Гимзе или фуксином. Боррелии при окраске по Романовскому-Гимзе —фиолетовые, фуксином — розовые (рис. 45б).

Световая микроскопия мазков, импрегнированных серебром.

Электронная микроскопия.

Боррелий обнаруживают в крови животных и гемолимфе клещей (микроскопируют раздавленного клеща либо ставят РИФ). Выявление инфицированных клещей, снятых с укушенных людей, имеет очень важное значение, так как позволяет проводить превентивную антибиотикотерапию Лайм-боррелиоза.